De krantencollectie is rijk ook al vormen nieuwskranten geen bijzonder aandachtspunt in het acquisitiebeleid van de Boekentoren. Er is een selectie van een 18-tal binnen- en buitenlandse titels die worden aangekocht: De Morgen, De Standaard, De Tijd, Het Laatste Nieuws, De Gentenaar, Het Nieuwsblad, Le Soir, L'Echo, Le Monde, NRC Handelsblad, De Volkskrant, Die Welt, Die Zeit, Frankfurter Allgemeine, El Païs, The Financial Times, The Times en The Wall Street Journal. De Boekentoren is de enige instelling die de volledige reeks van Het Laatste Nieuws heeft en alle jaargangen van de Vooruit zijn gedigitaliseerd en doorzoekbaar. In samenspraak met de Universiteit van Leuven en de Conscience bibliotheek heeft de boekentoren een depotplicht voor Le Monde en de Volkskrant. Van de Standaard worden enkel de weekendbijdragen bijgehouden. Voor de erfgoedkranten is vooral de conservatie een uitdaging, door verzuring en broosheid van het krantenpapier. Voor de aanwezige Gentse titels wordt actief naar aanvullingen gezocht. Die historische collectie is aanzienlijk, en is het resultaat van een bewust beleid dat in 1839 werd ingezet. Toenmalig hoofdbibliothecaris Auguste Voisin lukt in dat jaar van al de Gentse kranten een gratis exemplaar toegestuurd te krijgen. Die politiek van kosteloze abonnementen kan worden verdergezet onder zijn opvolger De Saint-Genois. Onder Vander Haeghen worden de kranten onderdeel van de verzamelambities, waarbij omvangrijke historische collecties toegevoegd worden aan de collectie door aankoop of schenking. Het gaat niet alleen meer om Gentse kranten, maar ook om titels als Le Journal de Bruxelles (1824-1896) of L’ Indépendance Belge (1831-1899) en om buitenlandse kranten. Voor zijn opvolger Willem De Vreese vallen de Duitstalige en activistische kranten die de collectie verrijkten, te vermelden. Vanaf de jaren 1920 verschuift het accent van verzamelen naar beheren. Bibliothecaris Carl Debaive is tijdens het interbellum verschillende jaren in de weer met het ordenen, beschrijven, klasseren en inventariseren van de krantencollectie. In de jaren 1960 en 1970 verricht zijn opvolger Frans Vandenhole monnikenwerk, dat leidt tot bijna zevenhonderd pagina’s Inventaris van nieuws-, vak- en kiesbladen in 1977. Voor de duurzame bewaring van historische kranten wordt momenteel ingezet op digitaliseringsprojecten. De Boekentoren is betrokken bij enkele landelijke projecten - https://www.belgicapress.be (toegang tot 28 titels tot 1950 gedigitaliseerd door de Koninklijke Bibliotheek), https://warpress.cegesoma.be/nl en https://nieuwsvandegrooteoorlog.hetarchief.be/ (kranten WO I – viaa)- en participeert aan https://krantencatalogus.be, een realisatie van de Vlaamse Erfgoedbibliotheek, een online databank van Belgische historische kranten die worden bewaard in bibliotheken en andere erfgoedinstellingen in Vlaanderen en Brussel. Tot nu toe werken 170 instellingen samen. Op de planning staat het digitaliseren van de kranten uit de Belle Epoque (ca. 1870-1914) omwille van de slechte kwaliteit van het krantenpapier in die periode.