De afdeling Bijzondere Collecties bevat een variatie aan documentair erfgoed. Oude drukken (van vóór 1830) vormen het gros van de collectie, maar ook manuscripten en handschriftfragmenten, moderne preciosa en prenten behoren tot de collectie. Verder bewaren we ook glasplaatjes en archiefdocumenten.

De samenstelling en inhoudelijke oriëntatie van de collectie is nauw verbonden met de geschiedenis van de universiteit. De kern ervan dateert uit de tijd van het Institut Saint-Ignace (1852) en de Sint-Ignatius Handelshogeschool (1902), voorlopers van het latere UFSIA (Universitaire Faculteiten Sint-Ignatius Antwerpen, 1965) dat in 2003 opging in de eengemaakte Universiteit Antwerpen. Later werd de verzameling uitgebreid met diverse onderzoekscollecties, schenkingen, bulkaankopen en aankopen op veilingen en in antiquariaten.