De abdijbibliotheek bleef in de tweede wereldoorlog gevrijwaard van de branden die gans Dendermonde verwoestten. Zoals in de context van een abdij te verwachten is, vormen de geesteswetenschappen de klemtoon van de collectie. Deze rijke bibliotheek herbergt enkele bijzondere fondsen, zoals het Fonds Jules Pieters (volkskunde). Daarnaast is deze bibliotheek ook rijk aan oude drukken en handschriften.
